1. 基因组注释信息

2. 进化树

3. 网络可视化

4. 序列比对

5. 质谱分析

6. 基因/蛋白质注释

7. 基因名转换

8. 结构域分析

9. 原核生物Transcription Unit查询

10. 探针设计

11. 统计学网址

Virtual Laboratories in Probability and Statistics

12. 生物学通路数据库

13. 转录调控数据库

  • RegPrecise 原核生物“转录因子–下游基因”数据库。

  • DBTBS 转录因子和相应的DNA结合保守(DNA binding motif)数据库。

14. 基因序列可视化

15. 蛋白质相互作用

  • PSICQUIC/PSISCORE 一个综合性蛋白质互作数据库,互作带有打分,发表文章。这个数据库和[IntAct]有重复。

  • STRING和对应的R/Bioconductor包STRINGdb 使用广泛的预测和实验验证的蛋白质互作数据库,STRINGdb包更提供了下载、benchmark和可视化等功能。

  • I2D 包括了果蝇、人、鼠等模式生物蛋白质互作。

  • BioGRID 多个物种。

  • Human Protein Reference Database 体内/体外相互作用。

  • 3did 结构域相互作用。

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2017年12月16日

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